吴谦（？—？），字六吉，安徽省徽州府歙县人，清朝著名医家。
其祖吴凤以务农为业。吴谦精通医术，尤以伤科见长，与喻昌、张璐齐名。官至太医院判，供奉内廷。乾隆中，敕编医书，命谦及同官刘裕铎为总修官，编著成《医宗金鉴》一书。《医宗金鉴》内容包括伤寒论，金匮要略，删补名医方论，四诊要诀，诸病心法要诀，正骨心法要旨，是清初重要的医学著作。
